# 「2019-nCoV-新型冠状病毒全球简报」- 2020.02.01

2020.02.01 睿睿睿 编辑

# 导读

「2019-nCoV-新型冠状病毒全球简报」是新型冠状病毒疫情期间,国内众多线上志愿者整理出的一份简报,志在帮助大家了解疫情最新信息。文中内容皆可溯源,包括国外各大医疗杂志和媒体的一手信息(含学术论文)。希望大家在疫情期间保护好自己,顺利渡过难关。

# 本期目录

  • 全球非学术信息
    • WHO新冠状病毒(2019-nCoV)情况报告-11
    • 惠康基金会 - 分享新型冠状病毒(2019-nCoV)暴发有关的研究数据和发现
    • 全球文章 - 随着冠状病毒蔓延,反中国人的情绪也是
  • 全球学术信息
    • JAMA - 公共卫生应急准备:全球化灾难,本地化威胁
    • JAMA -《在武汉源发的新型冠状病毒:对全球健康政策与管理的挑战》
    • bioRxiv - 新兴传染病疫情中保护性种群行为的变化
    • Science - 从冠状病毒基因组中寻找爆发源头的线索
    • NEJM - 德国一例2019-nCoV无症状患者的感染传播

# 全球非学术信息

# WHO - 新冠状病毒(2019-nCoV)情况报告-11

WHO | 2020.01.31(北京时间)

  • 内容来源:WHO 关于此次疫情的 situation report - 11 (1.31)

  • 数据概览:

    • 全球:7818 确诊病例
    • 中国:7736 确诊病例,12167 疑似病例,1370 严重病例,170 死亡病例
    • 其他地方:82 确诊病例,遍布 18 个国家
    • 世卫组织 WHO 的风险评估:
      • 中国:非常高
      • 区域性风险:高
      • 全球性风险:高
  • 重要情况 HIGHLIGHTS

    • 卫生部下属的新型冠状病毒应急委员会(2019-nCoV):1月30日重新召开了《国际卫生条例(2005年国际卫生条例)》。世卫宣布已爆发国际关注的突发公共卫生事件。应急委员会已向世界卫生组织,中华人民共和国以及所有国家和国际社会提供了控制措施的建议。这次爆发,委员会认为仍有中断病毒传播的可能,前提是各国采取强有力的、采取与风险相称的措施来检测疾病,尽早隔离和治疗案件,追踪联系并做出避免人群聚集的措施。
    • 今天,首两例的2019-nCoV急性呼吸道疾病在意大利确诊;两者都有前往武汉市的旅行历史。
    • 世卫组织风险沟通小组启动了一个新的信息平台,世卫组织流行病信息网络(EPI-WIN)。 EPI-WIN将采取一系列工具,发布针对特定目标群体的定制信息。 EPIWIN本周开始建立与医疗保健,旅行和旅游部门的合作,并将在下周与粮食和农业以及商业/雇主合作。

图1. 2020年1月31日报告有2019-nCoV确诊病例的国家或地区

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图1. 2020年1月31日报告有2019-nCoV确诊病例的国家,地区或地区 1G1iaq.png

中国确诊病例包括香港特别行政区确诊病例(12例确诊病例),澳门特别行政区确诊病例(7例确诊病例)和台北(9宗确诊个案)。

图2:按症状发作日期和发病日期在中国境外确定的2019-nCoV病例(n = 62)的流行曲线及旅行记录,2020年1月31日 1G1VRU.png (Date of symptom onset:症状发作日期)

图2的注释:在中国境外报告的106例病例中,有7例无症状。 其余99例,只有62例提供了发病日期的信息,体现在了流行病学曲线中。

图3:按报告日期和旅行历史在中国境外确诊的2019-nCoV病例(n = 106)的流行曲线,2020年1月31日 1G1JzD.png

# 惠康基金会 - 分享新型冠状病毒(2019-nCoV)暴发有关的研究数据和发现

(Wellcome Trust)| 2020.01.31)

新型冠状病毒在中国的爆发(2019-nCoV)是对全球健康的重大和紧迫威胁。我们呼吁研究人员、期刊和资助者确保与本次疫情有关的研究结果和数据得到迅速和公开的共享,以告知公共卫生应对并帮助拯救生命。我们重申对2016年《关于共享突发公共卫生事件数据的声明》所确定原则的承诺,并将努力确保世界卫生组织(世卫组织)能够迅速获得有助于全球应对的新发现。

具体而言,我们承诺共同努力,帮助确保:

  • 与疫情有关的所有同行评审的研究出版物立即开放获取,或至少在暴发期间免费提供
  • 与疫情有关的研究结果在提交期刊时立即与世卫组织、该期刊以及作者的知识共享
  • 研究结果可以在期刊发表前通过预印本服务器获得,也可以在同行评审前通过平台公开获取,并提供关于基础数据可用性的明确声明
  • 研究人员尽可能迅速和广泛地与公共卫生、研究界和世卫组织共享与疫情有关的中期和最终研究数据,以及用于收集数据的议定书和标准
  • 作者很清楚,在投稿前共享的数据或预印本不会抢先在这些期刊上发表

我们打算将本声明的原则应用于今后发生的类似疫情,确保数据的广泛和迅速共享对公共卫生具有重大益处。我们敦促其他国家作出同样的承诺。如果您的组织承诺支持这些原则,请联系我们(d.carr@wellcome.ac.uk),我们将把您的组织加入签署国名单

PS:惠康基金是英国最大的慈善基金会之一,致力于提高公民和动物的健康福利事业。是英国最大的生物医药研究赞助者之一,也是世界最大的生物医学研究基金之一。

# 全球文章 - 随着冠状病毒蔓延,反中国人的情绪也是

Motoko Rich | 01/31/2020

导语:由于恐慌蔓延,对爆发的恐惧加剧了仇外心理,有时甚至超出了实际担忧。

冠状病毒的迅速传播已使约9800人(中国绝大多数人,其中213人死亡)使人患病,这在全球范围内引发了一波恐慌,甚至在某些情况下,引起了强烈的反华情绪。

一些现象:在日本,Twitter 上的热门话题#ChineseDon’tComeToJapan 一直在流行。在新加坡,成千上万的居民签署了一份请愿书,呼吁政府禁止中国公民进入新加坡。在香港,韩国和越南,企业已经张贴了招牌,说不欢迎中国大陆客户。在法国,区域性报纸的头版头条警告“黄色警报”。在多伦多郊区,父母要求学区将最近从中国归国的一家家庭的孩子停课17天

“与中国有关的更广泛的政治和经济紧张局势和忧虑加剧了某些仇外心理,这些紧张局势与最近对传染病的担忧相互作用,”马诺阿夏威夷大学亚洲研究助理教授克里斯蒂·戈维拉说。对疫情的一些反应可以看作是基于感染风险的合理计算:航空公司正在取消飞往武汉,疫情中心和其他中国城市的航班,而会议组织者正在要求中国代表团不要参加。

# 全球学术信息

# JAMA - 公共卫生应急准备:全球化灾难,本地化威胁

Lawrence O. Gostin, JD | 2018.11.06

传染病是一个永恒的现实,然而它需要一个震动公众的注意力和刺激政治行动。 过去几周,美国繁忙机场发生了类似事件,3架航班被紧急隔离。 与此同时,似乎在另一个世界之外,不安全、薄弱的卫生系统和不信任正在助长今年刚果民主共和国(DRC)爆发的第二次大规模埃博拉疫情。 然而,对周期性冲击做出反应并不能保障我们共同的未来。 应急准备需要积极的计划和资金,美国的领导是关键。

# JAMA - 在武汉源发的新型冠状病毒:对全球健康政策与管理的挑战

Alexandra L. Phelan, SJD, LLM; Rebecca Katz, PhD, MPH; Lawrence O. Gostin | 2020.01.30

摘要:2019年12月31日,中国向世界卫生组织(WHO)报告了中国湖北省武汉市的肺炎病例,该病例由一种新型冠状病毒引起,目前命名为2019-nCoV。 越来越多的病例和死亡构成公共卫生和治理方面的重大挑战。 中国在湖北省实施了前所未有的防疫警戒线(一个防止任何人离开的警戒区) ,这也引发了关于其实施和有效性的争议。 现在,病例至少已扩散到四大洲。 截至一月二十八日,已有超过4500宗确诊个案(98% 在中国)及超过100宗死亡个案。1本专栏概述2019-nCoV 疫情的现况,评估疫情的应变,并提出控制疫情的策略建议。

非药物干预

在中国,整个湖北省的警戒线规模之大是前所未有的。卫生当局在1918-1919年的流感大流行期间隔离了主要城市,但对该流行病的扩散影响不大。西非埃博拉疫情(2013-2016)引发了隔离,例如利比里亚政府对隔离带的不成功和严重批评的封锁线蒙罗维亚西点的60,000至120,000人。该命令导致暴力和公众的不信任,有可能加剧埃博拉病毒的扩散。

获得公众的信任,对于任何公共卫生策略都是至关重要的。卫生系统应促进和鼓励个人迅速寻求测试和治疗,并与隔离、接触调查等遏制措施合作。根据武汉官员的说法,到中国实施警戒线卫生措施时,已经有多达500万人从武汉离开,回家过年。尽管社会隔离措施可能会延迟病毒传播,但湖北境内非自愿的行动限制可能会侵蚀社区信任并破坏与卫生当局的合作。在警戒线内部,后勤问题显而易见,已经导致药品和医疗设备短缺。由于医院和诊所人满为患,公共交通有限,有症状的人可能会延迟获得治疗的机会。还有可能人群聚集在拥挤的城市中,尽管方式不同,但仍可能导致感染。

除了对公共健康的影响外,执行禁闭卫生措施可能会侵犯人权,包括享有尊严,隐私和行动自由的权利。 《国际卫生条例(IHR)》禁止对国际旅行和贸易进行不必要的干预,同时还要求尊重旅行者的人权。各国必须采取必要的“最低限度”措施,以维护公共卫生。尽管边境筛查在检测过去疾病暴发中的病例有效性方面存在可疑之处,但美国官员实施的增强型非侵入性筛查似乎符合《国际卫生条例》的要求,但前提是必须在一种尊重旅行者尊严,人权和基本自由的方式。

# bioRxiv - 新兴传染病疫情中保护性种群行为的变化

Evans K Lodge, Annakate M Schatz, John M Drake | 2020.01.27

在疫情爆发期间,由于暂时缺乏有效药物和疫苗,我们需要进行非药物性公共卫生干预,并改变行为习惯,以降低人际传播。采取干预措施,让受感染者远离易感人群,是至关重要的,尤其是隔离和住院治疗。埃博拉出血热(EVD)、严重急性呼吸窘迫综合症(SARS)和中东呼吸窘迫综合症(MERS)均为人畜共患的传染病。它们都近引起过重大传染疾病,并在人际间持续传播。

本文研究了7次 EVD、 SARS 和 MERS 疫情,定量的改变 MMR (mean removal rates) 和 DSOH (days from symptom onset to hospitalization of infected individuals from the population),以观察这7次疫情爆发的统计学差异。

# Science - 从冠状病毒基因组中寻找爆发源头的线索

Jon Cohen | 2020-01-31

attaaaggtt tataccttcc caggtaacaa accaaccaac tttcgatctc ttgtagatct …

这一连串明显的胡言乱语其实完全不是胡言乱语,而是这种病毒病原体 DNA 序列的一个片段,被称为2019年新型冠状病毒(2019-nCoV) ,它势不可挡,震惊了整个世界。 科学家们正在公开分享越来越多的来自病人的病毒全部序列ーー在全球共享所有流感数据数据库的最新统计中有53个序列。 人们正在对这些病毒基因组进行深入研究,试图了解2019-nCoV 的起源,以及它如何与蝙蝠和其他物种中发现的相关病毒的系谱相吻合。 他们还瞥见了这种新发现的病毒的物理形态,它是如何改变的,以及如何阻止它。

2019-nCoV总共有近29,000个核苷酸碱基,这些碱基保存着产生这种病毒的遗传说明书。虽然它是许多基因以RNA形式存在的病毒之一,但科学家们将病毒基因组转换成DNA,其碱基简称为A、T、C和G,以便于研究。许多关于2019-nCoV序列的分析已经出现在virological.org、nextstrain.org、bioRxiv等预印本服务器上,甚至出现在同行评审的期刊上。中国研究人员共享这些序列,使世界各地的公共卫生实验室得以开发自己的病毒诊断方法。目前,已有18个国家发现了这种病毒。

当2019年第一个nCoV序列出现时,研究人员把它放在已知的冠状病毒的系谱图上,发现它与蝙蝠的亲缘关系最密切。武汉病毒学研究所石正丽领导的研究小组在bioRxiv 1月23日报道,2019年nCoV的序列是96.2%类似蝙蝠病毒和有79.5%相似 SARS冠状病毒但SARS冠状病毒与蝙蝠病毒有着类似的密切关系,序列数据有力地证明,它是从果子狸冠状病毒进入人体的,而果子狸冠状病毒与人类SARS病毒之间的差异仅为10个核苷酸。这就是为什么许多科学家怀疑在蝙蝠和2019-nCoV之间存在一个或多个“中间”宿主物种的原因之一。

根据 Bedford 的分析,石正丽团队强调的蝙蝠冠状病毒序列,被称为RaTG13,与2019-nCoV有近1100个核苷酸的不同。在nextstrain.org上,Bedford创建了冠状病毒家谱(见下图),其中包括蝙蝠、果子狸、SARS和2019-nCoV序列。(这些树是交互式的——通过在它们上面拖动鼠标,很容易看出序列之间的异同。)

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Bedford 对 RaTG13 和 2019-nCoV 的分析表明,这两种病毒在25~ 65年前有一个共同的祖先,这是他通过结合病毒之间核苷酸的差异和其他冠状病毒的假定突变率得出的估计。因此,类ratg13病毒突变为2019-nCoV可能需要几十年的时间。

另一种由冠状病毒引起的中东呼吸综合征(MERS)也与蝙蝠病毒有关。但研究已经建立了一个令人信服的案例,它从骆驼跳到了人类身上。来自石正丽的bioRxiv论文的系统发育树(见下)使得骆驼- mers的联系很容易被发现。

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一种病毒在人群中传播的时间越长,它就有更多的时间变异,从而区分受感染人群中的病毒株。考虑到到目前为止分析的2019-nCoV序列彼此之间最多有7个核苷酸的差异,这表明它是最近跳进人类体内的。但究竟是哪种动物将病毒传播给人类仍然是个谜。“在蝙蝠身上发现的病毒和现在从人类身上分离出来的病毒之间有一个非常大的灰色地带,”美国国家过敏和传染病研究所的病毒学家Vincent Munster说,他研究蝙蝠、骆驼和其他物种的冠状病毒。然而,目前还没有关于样本的预印本或官方科学报告,因此尚不清楚哪些动物被检测出阳性。斯克里普斯研究中心的进化生物学家克里Kristian Andersen说,“除非你不断地将病毒从一个单一物种中分离出来,否则很难尝试确定什么是自然宿主。”

# NEJM:2019-nCoV 感染在德国无症状接触者中的传播

Camilla Rothe, M.D. Mirjam Schunk, M.D. Peter Sothmann, M.D. Gisela Bretzel, M.D. Guenter Froeschl, M.D. Claudia Wallrauch, M.D. Thorbjörn Zimmer, M.D. Verena Thiel, M.D. Christian Janke, M.D. University Hospital LMU Munich, Munich, Germany | 2020.01.30

来自武汉的新型冠状病毒(2019-nCoV)目前正在引起医学界的关注,因为该病毒正在世界各地传播。1自2019年12月底发现以来,从中国输入到其他国家的病例数量呈上升趋势,流行病学情况每天都在发生变化。我们报告了一例在亚洲以外获得的2019-nCoV 感染病例,该病例的传播似乎发生在疾病潜伏期期间。

患者1:德国商人,33岁,身体健康。在2020年1月24日患上了喉咙痛、发冷和肌痛。第二天,出现39.1°C(102.4°F)的发烧,并伴有干咳。第二天晚上,他开始感觉好些了,并于1月27日重新开始工作。

在症状出现之前,他曾于1月20- 21日在慕尼黑附近的公司与一位中国商业伙伴开会。这位商业伙伴是上海居民,曾在1月19日至22日访问德国。在她逗留期间,她一直很好,没有感染的迹象或症状,但在返回中国的航班上病倒了。1月26日,她(源头患者,index patient)在中国的2019-nCoV检测呈阳性(索引患者见图1)。1月27日,她向公司报告了自己的病情。

病例追踪:患者1 被送往慕尼黑传染病和热带医学司作进一步评估。他在出现症状前14天内无既往或慢性疾病,也没有国外旅行史。获得2个鼻咽拭子和1个痰标本,经逆转录酶-聚合酶链反应(qRT-PCR)定量检测,2019-nCoV阳性。后续的qRT-PCR检测显示,在接下来的几天里,他的痰中病毒载量高达108份/毫升,最后一次检测结果是在1月29日。

图1:德国无症状感染患者的暴露时间.

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病例追踪:患者2\3\4 1月28日,该公司另外3名员工的2019-nCoV检测呈阳性(图1中的患者2,患者3,患者4)。

在这些患者中,只有患者2与源头患者有接触;另外2例仅与患者1有接触。根据卫生当局的要求,所有确诊2019-nCoV感染的患者均被收住慕尼黑传染病科进行临床监测和隔离。到目前为止,四例确诊患者均未出现严重的临床症状。

本例2019-nCoV感染在德国诊断,是一例传播到亚洲以外的病例。值得注意的是,感染似乎是在该源头患者的潜伏期传播的。无症状患者可能是2019-nCoV感染的事实,可能需要重新评估当前疫情的传播动态。在此背景下,2019-nCoV的检测和一个恢复期患者(患者1)的高痰病毒载量引起了人们对2019-nCoV在康复后长时间减少的关注。然而,通过qRT-PCR检测到该患者2019-nCoV的生存能力仍需通过病毒培养来证实。

尽管存在这些担忧,在慕尼黑见到的所有4名患者都有轻微的病例,住院主要是为了公共卫生目的。由于医院的能力有限,特别是考虑到北半球同时出现的流感季节高峰,因此需要进行研究,以确定这些患者是否可以在医院之外接受适当的指导和监督